Cuộc sống của Azusagawa Sakuta đã bước sang một trang mới kể từ khi cậu bắt gặp một nàng thỏ hoang trong thư viện. Cô nàng ấy chính là Sakurajima Mai, đàn chị khóa trên của cậu tại trường trung học phổ thông Minegahara, đồng thời cũng từng là một diễn viên nhí nổi tiếng. Có vẻ như ngoài Sakuta, không ai chú ý đến sự tồn tại của Mai cả. Gọi hiện tượng ấy là “Hội chứng tuổi dậy thì”, Sakuta đã quyết định cùng Mai giải mã những bí ẩn liên quan đến hội chứng của cô, và mối quan hệ của hai người cũng ngày càng gắn bó chặt chẽ…
HỘI CHỨNG TUỔI THANH XUÂN là câu chuyện kể về những cô gái mắc phải những rối loạn tâm lý dẫn tới các hiện tượng siêu nhiên kỳ lạ gọi là “Hội chứng tuổi dậy thì” như xóa bỏ sự tồn tại của bản thân, lặp lại thời gian, doppelganger… Cùng với Sakurajima Mai, Azusagawa Sakuta đã giải quyết những khúc mắc đó - giải quyết “Hội chứng tuổi dậy thì”, đồng thời ở bên trong cậu cũng có những sự thay đổi lớn lao.